เนื้อเรื่อง
มนุษยชาติกำลังต่อสู้กับศัตรูที่มีตัวตนไม่แน่ชัด รูปร่างของพวกมันอธิบายได้แค่ว่าเป็นแมลง ศัตรูข้ามออกมาจากช่องว่างกาลเวลาด้วยเทคนิคและความสามารถทางวิทยาศาสตร์ในระดับสูง เมื่อต่อสู้กับเกตเตอร์เสร็จสิ้นแล้วพวกมันก็จะหายไปอย่างไร้ร่องรอย
"ทาคุมะ" กับ "บาคุ" สองเพื่อนซี้ถูกจิตสำนึกของเกตเตอร์เรียกตัวมายังสถาบันวิจัยซาโอโตเมะเพื่อขับเคลื่อนหุ่นยนต์เกตเตอร์แล้วรวมร่างกับหุ่นยนต์เกตเตอร์ของ "คามุย" กลายเป็นหุ่นเกตเตอร์ที่แข็งแกร่งที่สุดของมนุษยชาติเรียกว่า "อาร์ก" ต่อกรกับศัตรู…