แม้ผู้คนบนเกาะวาฬโคลนจะใช้ชีวิตร่วมกันอย่างกลมกลืน แต่ก็มีสิ่งที่แบ่งแยกลักษณะของพวกเขาคือ ‘ไซเมีย’ (Thymia) ซึ่งเป็นพลังพิเศษที่มีพื้นฐานในการควบคุมวัตถุ ผู้ที่มีไซเมียจะมีอายุไขทั้งสั้นกว่าคนปกติ (ราว 30 ปี) เรียกว่า ‘ชิรุชิ’ ส่วนผู้ที่ไม่มีไซเมียจะถูกเรียกว่า ‘มุอิน’ ซึ่งมีอายุยืนยาวกว่า
การเดินทางของเกาะวาฬโคลนยังคงไม่สิ้นสุดลง แต่แล้วก็เกิดเหตุการณ์ที่นำมาซึ่งความเปลี่ยนแปลงและความสูญเสียครั้งสำคัญเมื่อเกาะวาฬโคลนตกเป็นเป้าหมายในการทำลายล้างของจักรวรรดิ เหล่าผู้ที่คนบนเกาะวาฬโคลนที่ใช้ชีวิตอย่างสงบสุขจึงต้องต่อสู้เพื่อเอาชีวิตรอดและไขปริศนาที่ซ่อนอยู่เบื้องหลังของโลก
ชาคูโร (Chakuro)
เด็กหนุ่มผู้ทำหน้าที่จดบันทึกเหตุการณ์ต่างๆที่เกิดขึ้นบนเกาะวาฬโคลน ชาคูโรอยากรู้เรื่องราวเกี่ยวกับโลกเขาจึงตั้งใจศึกษาและบันทึกเรื่องราวต่างๆเพื่อส่งต่อให้คนรุ่นหลังต่อไป
ลีคอส (Lykos)
เด็กสาวจากเกาะไร้ผู้คนที่ชาคุโระพากลับมาที่เกาะวาฬโคลน ลีคอสเป็นน้องสาวของผู้บัญชาการเรือรบของจักรวรรดิ เธอมีจิตใจที่ว่างเปล่าเพราะมอบความรู้สึกให้นูส (รูปร่างของจิตวิญญาณ) กลืนกินไป
ซามิ (Sami)
เพื่อนสนิทของชาคุโระที่เติบโตและฝึกการใช้ไซเมียมาด้วยกัน ซามิเป็นน้องสาวของซูโอ ในช่วงที่วาฬโคลนถูกกองทัพจักรวรรดิโจมตีซามิใช้ตัวเองปกป้องชารุโคะเอาไว้
โอนิ (Ouni)
หัวหน้าตัวตุ่นใต้ท้องวาฬ (คนที่ทำความผิดจนต้องถูกนำไปขังที่ใต้ท้องวาฬโคลน) โอนิมีไซเมียที่แข็งแกร่งมาก เขาปรารถนาที่จะออกจากวาฬโคลนเพื่อเผชิญกับโลกอันกว้างใหญ่
ซูโอ (Suou)
พี่ชายของซามิผู้ทำหน้าที่รวบรวมบันทึกของชาคูโร ซูโอพยายามทำการวิจัยเพื่อหาทางยืดอายุไขของชิรุชิ เขาถูกแต่งตั้งเป็นประมุขคนใหม่หลังจากวาฬโคลนถูกโจมตี
กินซู (Ginshu)
สมาชิกหน่วยป้องกันตัวเองของวาฬโคลน กินซูชอบให้คนเรียกตัวเองว่าพี่สาว เธอเฝ้ามองชาคุโระที่กำลังเศร้าและคอยให้การช่วยเหลือชาคุโระ
ชูอัน (Shuan)
หัวหน้าหน่วยป้องกันตัวเองของวาฬโคลน ชูอันเป็นผู้ใช้ไซเมียที่แข็งแกร่งมากๆ เขาดุเหมือนคนไร้ความรู้สึกและจะทำทุกอย่างเพื่อภารกิจของวาฬโคลนโดยไม่สนใจสิ่งอื่น
ริโอดาริ (Ryodari)
เพื่อนสนิทของลิคอสที่ขึ้นเรือรบของจักรวรรดิมาโจมตีวาฬโคลน ริโอดาริเป็นพวกไร้ความรู้สึกในด้านลบโดยเขาจะรู้สึกสนุกสุดๆเมื่อได้เข่นฆ่าเป้าหมายที่อ่อนแอไร้ทางสู้
ออร์ก้า (Orca)
ผู้บัญชาการสคิลอส (เรือรบของจักรวรรดิ) ที่ได้รับมอบหมายภารกิจในการโจมตีวาฬโคลน ออร์ก้าเป็นพี่ชายของลิคอส เขาใช้น้องสาวตัวเองเพื่อทดลองผลกระทบที่อาจเกิดขึ้นบนวาฬโคลน